Tujuan utamanya adalah memastikan bahwa sistem elektronik yang beroperasi di Indonesia mematuhi standar keamanan dan privasi data, serta untuk melindungi hak-hak pengguna layanan digital.

Penyelenggara sistem elektronik yang tidak mendaftarkan diri atau beroperasi tanpa TDPSE bisa dikenakan sanksi oleh pemerintah, mulai dari teguran, denda, hingga pemblokiran layanan atau penghentian operasional.